Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms