Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF1O43189 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF1O43189 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF1O43189 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF1O43189 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHF1O43189 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHF1O43189 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms