Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CRXO43186 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CRXO43186 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CRXO43186 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CRXO43186 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms