Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1AO15047 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms