Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
U2SURPO15042 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2SURPO15042 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms