Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASKO14936 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASKO14936 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASKO14936 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASKO14936 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms