Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F3O00716 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F3O00716 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2F3O00716 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F3O00716 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms