Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELL2O00472 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELL2O00472 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELL2O00472 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELL2O00472 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ELL2O00472 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms