Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H7C1D1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H7C1D1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
H7C1D1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H7C1D1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H7C1D1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
H7C1D1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H7C1D1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H7C1D1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
H7C1D1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms