Protein–RNA interactions for Protein: B3EWG5

FAM25C, Protein FAM25C, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM25CB3EWG5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM25CB3EWG5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms