Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPT2A6NK58 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LIPT2A6NK58 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms