Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CFAP73A6NFT4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CFAP73A6NFT4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms