Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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IGKV2-40A0A087WW87 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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IGKV2-40A0A087WW87 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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IGKV2-40A0A087WW87 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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IGKV2-40A0A087WW87 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
IGKV2-40A0A087WW87 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IGKV2-40A0A087WW87 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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