Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms