Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PKP3Q9Y446 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PKP3Q9Y446 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms