Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN3Q9UPQ7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms