Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSR3Q9UNL2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms