Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD4Q9ULV1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FZD4Q9ULV1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms