Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF221Q9UK13 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms