Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HMGXB4Q9UGU5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms