Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VTI1BQ9UEU0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VTI1BQ9UEU0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms