Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFDP1Q9UEE9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms