Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLHL13Q9P2N7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms