Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RRBP1Q9P2E9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RRBP1Q9P2E9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms