Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC88CQ9P219 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC88CQ9P219 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms