Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
CCDC180Q9P1Z9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC180Q9P1Z9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC180Q9P1Z9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms