Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSD3Q9NYI0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSD3Q9NYI0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PSD3Q9NYI0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSD3Q9NYI0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSD3Q9NYI0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSD3Q9NYI0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PSD3Q9NYI0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSD3Q9NYI0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSD3Q9NYI0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSD3Q9NYI0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PSD3Q9NYI0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PSD3Q9NYI0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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