Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZDHHC3Q9NYG2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms