Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NLE1Q9NVX2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms