Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH2B1Q9NRF2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH2B1Q9NRF2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms