Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NRIP3Q9NQ35 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms