Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFT1Q9NNX1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms