Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MTMR12Q9C0I1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms