Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL4Q9C0H6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms