Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ROPN1BQ9BZX4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ROPN1BQ9BZX4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms