Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFHD1Q9BUP0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFHD1Q9BUP0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFHD1Q9BUP0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EFHD1Q9BUP0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms