Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MESP1Q9BRJ9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms