Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USB1Q9BQ65 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms