Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SMIM7Q9BQ49 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SMIM7Q9BQ49 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms