Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SEMA3CQ99985 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms