Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIT2Q99578 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIT2Q99578 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms