Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms