Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC4A9Q96Q91 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC4A9Q96Q91 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms