Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CENPNQ96H22 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms