Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFHD2Q96C19 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms