Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PHF3Q92576 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHF3Q92576 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms