Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAAF4Q8WXU2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAAF4Q8WXU2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms