Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C17orf50Q8WW18 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C17orf50Q8WW18 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms