Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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C15orf40Q8WUR7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C15orf40Q8WUR7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C15orf40Q8WUR7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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C15orf40Q8WUR7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C15orf40Q8WUR7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C15orf40Q8WUR7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C15orf40Q8WUR7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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C15orf40Q8WUR7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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C15orf40Q8WUR7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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C15orf40Q8WUR7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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C15orf40Q8WUR7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C15orf40Q8WUR7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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C15orf40Q8WUR7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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