Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNX29Q8TEQ0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNX29Q8TEQ0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms